方砚见药液收效，心中稍定，又留于契丹部落半月，细察牲畜的恢复状况，不断调整药液配比。他发现牛羊的体质与人体不同，寒湿之毒更易积于皮毛与肠胃，便又加入辽东特有的苍术、茯苓，制成专治牲畜寒疫的冷萃祛寒散，既可拌入草料喂食，又能煎水涂抹患处，用法更为简便。契丹百姓依方施治，不出一月，部落里的牛羊便尽数痊愈，原本凋敝的牧场，又恢复了往日的生机。
契丹首领耶律阿骨里亲自率部众抬着牛羊、皮毛前往辽阳善益堂致谢，对着方砚躬身道：“方提点救我契丹部族于危难，往日我等只知放牧狩猎，不知医理，今愿奉善益堂马首是瞻，部落中凡有识字子弟，皆愿入堂习医，既治人，亦治畜。”方砚欣然应允，将耶律阿骨里所赠之物分予辽东各药站的医者与寒门学徒，又与契丹部落商定，在契丹牧地与长白山药田之间，开辟一处牲畜医站，派善益堂弟子驻站施治，同时教契丹子弟辨识药材、制作畜医药液。
方砚又将治牲畜疫疾的诸般法子一一记录，绘制药材图谱，标注药液配比，送至长安善益堂总院。张云霄与秦御医见了，连连称奇，叹道：“医道本无界，人畜虽殊，然疾疫之理相通，方砚此举，开我大唐畜医之先河也。”二人当即令药科院专设**畜医科**，抽调精通药理的医者，与方砚一同完善畜医之法，又将辽东的苍术、茯苓，契丹牧地的野蓟草等入畜医药方，编入《大唐冷萃药汇》，另立**畜医卷**，刻版刊行，分送各道牧地、军营。
大唐军营多蓄战马，往日战马常因疫疾折损，畜医卷传至军中，各营军医依方制药，战马的疫疾竟锐减八成，军中将士皆赞善益堂之功。方砚又在辽阳善益堂开设畜医学堂，招收汉、靺鞨、契丹、奚等部族子弟，凡愿习畜医者，皆一视同仁，倾囊相授。短短半年，辽东便培养出三十余名畜医弟子，分赴各牧地、军营，大唐的医道，自此不仅惠及黎民，更护佑六畜，边疆牧业与军伍后勤，皆因之愈发稳固。
贞观二十一年春，江南突降暴雨，连月不休，长江、太湖水位暴涨，多处堤岸溃决，水乡泽国一片汪洋。洪水所过之处，庐舍尽毁，淤泥淤积，饮水被污，不出十日，苏州、湖州、杭州一带便爆发了水疫，百姓染疾者甚众，多上吐下泻、身热乏力，柳清和正在江南巡查医政，见此情景，当即下令江南各道善益堂开启紧急防疫之策。
柳清和深知水疫之害，源于污浊之水与腐物滋生，首要便是净水防疫。他令工匠赶制千余只陶制滤水器，以木炭、鹅卵石、菖蒲根层层铺垫，教百姓滤水饮用，又令水上药坊尽数出动，沿江河湖汊喷洒冷萃菖蒲消毒液，净化水源。又取江南的藿香、佩兰、马齿苋，配伍制成冷萃清瘟止泻液，此液制法简易，只需以井水浸泡一日便可饮用，柳清和令药舟载着药液，驶入各村寨，免费施予百姓，又教百姓就地取材，自行制作。
彼时太湖沿岸的渔村被洪水围困，药舟难至，柳清和便令弟子乘轻舟，冒雨渡湖，又联络江南水师，令水师战船改作临时药船，载着药材与医者前往救援。渔村百姓多因涉水染疾，关节肿痛，柳清和又将江南的海风藤、络石藤与祛湿的薏米配伍，制成冷萃熏洗药液，教百姓煮水熏洗关节，数日便见成效。