当辽东的冰雪尚未消融时，江南道已迎来了连绵的梅雨季。
江南水乡，河网密布，梅雨季时阴雨连绵，空气潮湿，污水淤积，极易引发痢疾。这年的梅雨季来得格外早，雨势也格外大，扬州、苏州、杭州等地接连爆发痢疾疫情，尤其是乡村地区，百姓饮用了被污染的河水，纷纷上吐下泻，体质孱弱的老人孩童更是性命垂危。
柳清和此时正主持江南道善益堂总堂，坐镇扬州。得知疫情爆发，他立刻下令关闭扬州城外的污水口，引山泉入村，让百姓饮用干净的水源，同时命各州县分堂的医者奔赴乡村，诊治痢疾患者。
柳清和出身江南柳氏，对江南的水土气候了如指掌。他知道江南的痢疾，多为湿热痢，由湿毒、疫毒混杂所致，与北方的寒痢不同，需以“清热利湿，解毒止痢”为治则。冷萃法制作的药液，清利湿热之效尤佳，正好对症。
他取黄连、黄柏、白头翁、秦皮等清热解毒之药，又加入茯苓、薏苡仁、车前子等利水渗湿之药，用江南的梅雨潭水冷萃——潭水清澈，湿气轻，能更好地发挥药材的清利之效。浸泡两日后，过滤出药液，加入少许冰糖调味，制成“冷萃痢停液”。这药液入口微苦，却能快速止痢，成人每日服用三次，孩童减半，一般一日便能见效，三日便可痊愈。
对于重症痢疾患者，柳清和则采用针药并用之法，先喂服痢停液，再刺天枢、足三里、上巨虚等穴，疏通肠腑，调和气血。同时，他教百姓们用艾草、苍术熏烧屋舍，净化空气，用大蒜捣碎泡水饮用，预防痢疾，还让分堂的医者们在乡村设立净水点，用明矾净化河水，从根源上杜绝疫情扩散。
苏州分堂的医者，还发现江南的荷叶有清热利湿之效，便将荷叶切碎，与痢停液同煮，制成荷叶痢停汤，口感更清润，也更适合江南百姓的口味。柳清和得知后，立刻将此法推广至江南各分堂，还让医者们采集新鲜荷叶，阴干后储备起来，以备来年梅雨季之用。
此次江南痢疾疫情，因柳清和应对及时，方法得当，仅用了十日便被全面控制，未造成大规模的人员伤亡。扬州刺史亲自为善益堂送上牌匾，上书“梅雨安澜”四个大字，称赞柳清和“以医护民，以术安邦”。
柳清和并未沾沾自喜，他深知江南水乡疫情易反复，便着手制定了江南道的《水乡防疫章程》，其中详细记载了梅雨季、伏天的防疫之法，包括净水、排污、熏治、食疗等，还将冷萃痢停液、荷叶痢停汤的制作方法刻在石碑上，立在各乡村的村口，让百姓们时时可见。